종합부동산세, 부동산 보유 시 과세 대상은? 세액 계산과 공제 방법

종합부동산세 · 2026.08.27
종합부동산세, 부동산 보유 시 과세 대상은?
세액 계산과 공제 방법

종합부동산세는 매년 6월 1일을 기준으로 보유한 주택과 토지의 공시가격이 일정 금액을 넘을 때 부과될 수 있는 국세예요. 재산세와 별도로 부과되며, 실제 거래가격이나 시세가 아닌 공시가격을 기준으로 계산해요.

그렇다고 공시가격이 기준금액을 넘는 모든 사람이 종부세를 내는 것은 아니에요. 소유지분과 주택 수, 1세대 1주택 여부, 합산배제 및 과세특례까지 함께 살펴봐야 해요.

그렇다면 내가 보유한 주택도 종부세 과세 대상일까요? 부부 공동명의이거나 상속주택을 함께 보유하고 있다면 계산방법은 어떻게 달라질까요?

이번 글에서는 세이브택스(SAVETAX) 환급과 함께 종합부동산세의 뜻부터 과세 대상과 계산방법, 세율, 납부기간, 공제·특례 및 경정청구까지 차례대로 알아볼게요.

종합부동산세란? 재산세와 무엇이 다를까요?

재산세와 종합부동산세 차이 — 재산세(지방세)는 부동산 소유자에게 소재지별로 지방자치단체가 부과하고, 종합부동산세(국세)는 공제기준을 초과하면 전국 부동산을 유형별로 합산해 국세청이 부과합니다. 과세기준일은 둘 다 매년 6월 1일입니다

재산세와 종합부동산세는 모두 부동산을 보유할 때 발생하는 세금이에요. 다만 세금을 부과하는 기관과 계산방법이 달라요.

구분

재산세

종합부동산세

세금의 종류

지방세

국세

부과 기관

부동산 소재지 관할 지방자치단체

국세청

과세 기준일

매년 6월 1일

매년 6월 1일

계산 기준

부동산별 과세표준

소유자별로 전국의 주택·토지를 유형별 합산

일반적인 납부 시기

부동산 유형에 따라 7월·9월 등

12월 1일~12월 15일

재산세는 부동산이 있는 지방자치단체에서 부과해요. 반면 종부세는 한 사람이 전국에 보유한 주택과 토지를 유형별로 합산해 국세청에서 부과해요.

따라서 하나의 부동산에 재산세와 종부세가 모두 부과될 수 있어요. 다만 동일한 부동산에 세금이 중복되는 부담을 조정하기 위해 종부세를 계산할 때 일정한 재산세액을 공제해요.

나는 종합부동산세 대상일까요?

종부세 과세 대상은 매년 6월 1일 현재의 부동산 소유 현황을 기준으로 판단해요.

개인이 보유한 주택은 소유자별로 전국의 주택 공시가격을 합산해요. 합계액이 9억 원을 초과하면 주택분 종부세 과세 대상이 될 수 있어요.

요건을 충족한 1세대 1주택자는 12억 원을 공제받을 수 있어요. 다만 다른 세대원이 주택을 보유하고 있거나 부부 공동명의로 주택을 소유하고 있다면 적용 방식이 달라질 수 있어요.

기본적인 공제금액은 다음과 같아요.

과세 대상

기본공제

개인이 보유한 주택

9억 원

1세대 1주택자가 보유한 주택

12억 원

종합합산토지

5억 원

별도합산토지

80억 원

일반 법인이 보유한 주택

원칙적으로 기본공제 없음

여기서 기준이 되는 금액은 시세나 실제 매매가격이 아니라 공시가격이에요.

예를 들어 주택 시세가 12억 원이더라도 공시가격이 9억 원 이하이고 다른 주택이 없다면 주택분 종부세가 발생하지 않을 수 있어요. 반대로 여러 주택의 공시가격을 합산한 금액이 공제기준을 넘으면 과세 대상이 될 수 있고요.

공동명의 주택은 각 소유자가 자신의 지분에 해당하는 공시가격을 기준으로 과세 여부를 판단해요.

법인이 보유한 주택도 기본공제를 받을 수 있을까요?

일반 법인이 보유한 주택에는 원칙적으로 개인과 같은 기본공제가 적용되지 않아요. 주택분 세율도 개인과 다르게 적용될 수 있어요.

다만 공익법인 등 법에서 정한 일부 법인은 신청을 통해 기본공제와 일반 누진세율을 적용받을 수 있어요. 법인의 유형과 사업 목적, 신청 여부에 따라 결과가 달라질 수 있으므로 별도의 요건을 확인해야 해요.

구체적인 기본공제 기준은 「종합부동산세법」 제8조 에서 확인할 수 있어요.

종합부동산세는 어떻게 계산할까요?

종합부동산세 계산 5단계 — 공시가격 합산(개인별 전국 주택 합계), 기본공제(9억 원 또는 12억 원), 과세표준(남은 금액 × 60%), 세율 적용(과세표준 구간별 계산), 공제 반영(재산세액·세액공제 반영). 예: 공시가격 11억 원 − 기본공제 9억 원 = 2억 원 × 60% → 과세표준 1억 2,000만 원

개인의 주택분 종부세는 주택 공시가격 합계에서 기본공제를 빼고 공정시장가액비율을 적용한 뒤 세율과 각종 공제를 반영해 계산해요.

기본적인 흐름은 다음과 같아요.

(주택 공시가격 합계 − 기본공제 9억 원 또는 12억 원) × 공정시장가액비율 60% = 과세표준

과세표준을 구한 뒤에는 해당 세율과 누진공제, 공제할 재산세액, 1세대 1주택자 세액공제 등을 반영해요.

과세표준에 따른 세액 − 공제할 재산세액 − 1세대 1주택자 세액공제 = 종부세액

종합합산토지와 별도합산토지는 각각의 공제금액을 뺀 뒤 공정시장가액비율 100%를 적용해요.

구분

주택분

종합합산토지분

별도합산토지분

기본공제

9억 원1세대 1주택자 12억 원

5억 원

80억 원

공정시장가액비율

60%

100%

100%

자세한 계산 과정은 국세청 종합부동산세 과세표준·세액 계산 안내 에서 확인할 수 있어요.

공시가격 11억 원인 주택은 어떻게 계산할까요?

1세대 1주택자가 아닌 개인이 공시가격 11억 원의 주택을 보유했다고 가정해 볼게요.

  1. 공시가격 11억 원에서 기본공제 9억 원을 빼요.

  2. 남은 2억 원에 공정시장가액비율 60%를 적용해요.

  3. 종부세 과세표준은 1억 2,000만 원이 돼요.

  4. 과세표준 구간에 해당하는 세율과 누진공제를 적용해요.

  5. 공제할 재산세액 등을 반영해 최종 세액을 계산해요.

공시가격에서 기본공제를 뺀 2억 원에 세율을 바로 곱하는 것은 아니라는 점이 중요해요.

이 사례는 계산 구조를 설명하기 위해 단순화한 것이에요. 실제 세액에는 주택 수와 소유지분, 재산세액 공제, 세액공제 및 세 부담 상한 등이 반영될 수 있어요.

농어촌특별세도 함께 내야 할까요?

종부세가 발생하면 종부세액의 20%에 해당하는 농어촌특별세도 함께 부과돼요.

예를 들어 최종 종부세액이 100만 원이라면 농어촌특별세 20만 원이 더해져 총 120만 원을 납부하게 돼요.

종합부동산세 세율은 얼마나 될까요?

개인이 보유한 주택의 종부세율은 과세표준과 주택 수에 따라 달라져요.

과세표준

2주택 이하

3주택 이상

3억 원 이하

0.5%

0.5%

3억 원 초과 6억 원 이하

0.7%

0.7%

6억 원 초과 12억 원 이하

1.0%

1.0%

12억 원 초과 25억 원 이하

1.3%

2.0%

25억 원 초과 50억 원 이하

1.5%

3.0%

50억 원 초과 94억 원 이하

2.0%

4.0%

94억 원 초과

2.7%

5.0%

3주택 이상을 보유했다고 해서 과세표준 전체에 5%가 적용되는 것은 아니에요. 과세표준 구간별로 세율이 높아지는 누진세율 구조예요.

토지분 세율은 토지의 분류에 따라 다음과 같이 적용돼요.

  • 종합합산토지: 1.0~3.0%

  • 별도합산토지: 0.5~0.7%

일반 법인이 보유한 주택에는 개인과 다른 단일세율이 적용될 수 있어요. 일반 누진세율 적용 특례 대상 법인은 계산방법이 달라질 수 있으므로 법인의 유형도 함께 확인해야 해요.

세부 세율은 국세청 종합부동산세 세율 안내 에서 확인할 수 있어요.

종합부동산세는 언제 납부할까요?

종부세는 매년 6월 1일 현재 부동산 소유자에게 부과돼요. 일반적인 납부기간은 12월 1일부터 12월 15일까지예요.

6월 1일을 전후해 부동산을 매매했다면 계약일만 봐서는 안 돼요. 잔금 지급일과 등기접수일, 실제 소유권 이전 시점을 함께 확인해야 해요.

매도인과 매수인이 계약서에서 종부세를 따로 정산하기로 약정할 수는 있어요. 하지만 이는 당사자 사이의 비용 정산일 뿐, 세법상 납세의무자가 바뀌는 것은 아니에요.

종합부동산세는 국세청이 세액을 계산해 고지하는 방식이 기본이에요. 납세자가 직접 신고·납부하는 방법을 선택할 수도 있어요. 이 경우 기존 고지세액은 취소되고 신고한 내용에 따라 납부하게 돼요.

종합부동산세도 나누어 낼 수 있을까요?

농어촌특별세를 제외한 종부세 납부액이 250만 원을 초과하면 신청을 통해 일부 금액을 나누어 낼 수 있어요.

종합부동산세 납부액

분납할 수 있는 금액

250만 원 초과 500만 원 이하

250만 원을 초과하는 금액

500만 원 초과

납부세액의 50% 이하

분납기간은 납부기한이 지난 날부터 6개월 이내예요. 실제 분납 대상 금액과 납부기한은 해당 연도의 고지서를 확인하는 것이 좋아요.

종합부동산세를 줄일 수 있는 절세 방법은 무엇일까요?

종합부동산세 공제와 특례 핵심 정리 — 1세대 1주택자는 기본공제 12억 원과 연령·보유기간 세액공제(합계 최대 80%), 부부 공동명의 1주택은 각각 9억 원 공제 또는 특례 신청 시 12억 원 공제, 합산배제·주택 수 특례는 공시가격 합산에서 제외하거나 1주택자로 판단합니다

종부세를 불필요하게 많이 내지 않으려면 법에서 정한 기본공제와 세액공제, 합산배제 및 과세특례가 정확하게 적용됐는지 살펴봐야 해요.

단순히 주택 명의를 바꾸는 것보다 현재 적용할 수 있는 공제와 특례를 먼저 확인하는 것이 중요해요.

1세대 1주택자 공제 확인하기

요건을 충족한 1세대 1주택자는 12억 원의 기본공제를 적용받을 수 있어요. 연령과 주택 보유기간에 따른 세액공제도 받을 수 있고요.

구분

요건

공제율

연령별 공제

만 60세 이상 65세 미만

20%

연령별 공제

만 65세 이상 70세 미만

30%

연령별 공제

만 70세 이상

40%

보유기간별 공제

5년 이상 10년 미만

20%

보유기간별 공제

10년 이상 15년 미만

40%

보유기간별 공제

15년 이상

50%

연령별 공제와 보유기간별 공제는 함께 적용할 수 있어요. 다만 두 공제를 합한 한도는 80%예요.

일시적 2주택이나 상속주택, 지방 저가주택 등 특례주택을 함께 보유한 경우에는 세액공제 적용 방식이 달라질 수 있어요.

부부 공동명의 1주택자 특례 비교하기

부부가 주택 한 채를 공동명의로 보유하면 원칙적으로 각 배우자가 자신의 지분에 해당하는 공시가격에서 각각 9억 원을 공제해요. 다만 이 방식에서는 연령과 보유기간에 따른 세액공제를 받을 수 없어요.

부부 공동명의 1주택자 특례를 신청하면 부부가 합의해 한 명을 납세의무자로 정할 수 있어요. 이 경우 부부의 주택 지분을 합산한 뒤 12억 원의 기본공제와 납세의무자의 연령·보유기간 세액공제를 적용해요.

구분

공동명의 기본 방식

공동명의 1주택자 특례

납세의무자

부부가 각각 납세

부부 중 한 명

기본공제

각 배우자 9억 원

합산해 12억 원

연령 세액공제

적용되지 않음

요건 충족 시 적용

보유기간 세액공제

적용되지 않음

요건 충족 시 적용

신청 필요 여부

별도 신청 없음

신청 필요

어느 방식이 유리한지는 다음 항목에 따라 달라져요.

  • 주택 공시가격

  • 부부의 소유지분

  • 납세의무자로 정할 사람의 연령

  • 주택 보유기간

  • 적용 가능한 세액공제율

특례를 처음 신청하는 경우 일반적으로 해당 연도 9월 16일부터 9월 30일까지 신청해요. 공시가격이 높거나 보유기간이 길다면 두 방식의 예상 세액을 비교해 보는 것이 좋아요.

합산배제와 주택 수 특례 확인하기

일정한 요건을 갖춘 임대주택, 사원용 주택, 어린이집용 주택 등은 합산배제를 신청할 수 있어요.

상속주택과 지방 저가주택, 일시적 2주택 및 인구감소지역주택 등은 요건을 충족하면 1세대 1주택자 여부를 판단할 때 주택 수에서 제외될 수 있어요.

두 제도는 적용 효과가 달라요.

구분

적용 효과

합산배제

해당 주택의 공시가격을 종부세 과세표준 합산 대상에서 제외해요.

주택 수 특례

1세대 1주택자를 판단할 때 주택 수에서 제외하지만, 해당 주택의 공시가격은 과세표준에 합산될 수 있어요.

주택 수에서 제외된다고 해서 해당 주택의 공시가격까지 항상 빠지는 것은 아니에요.

합산배제와 과세특례 신고·신청은 일반적으로 9월 16일부터 9월 30일까지 진행해요. 특례마다 취득 시기와 공시가격, 소재지 및 보유기간 등의 요건이 다르므로 해당 연도의 기준을 확인해야 해요.

자세한 내용은 국세청 종합부동산세 합산배제 및 과세특례 안내 에서 확인할 수 있어요.

종부세를 줄이기 위해 부부나 가족에게 주택 지분을 옮기는 것도 신중해야 해요. 증여세와 취득세가 발생할 수 있고 향후 양도세에도 영향을 줄 수 있기 때문이에요. 명의를 변경하기 전에는 전체 세 부담을 함께 비교하는 것이 좋아요.

종합부동산세도 경정청구가 가능할까요?

종합부동산세를 이미 냈더라도 공제나 특례가 잘못 반영돼 세금을 실제보다 많이 부담했다면 경정청구를 검토 할 수 있어요.

대표적으로 다음과 같은 사례가 있어요.

  • 합산배제 대상 주택이 과세표준에 포함된 경우

  • 1세대 1주택자 판단이 잘못된 경우

  • 부부 공동명의 1주택자 특례가 제대로 반영되지 않은 경우

  • 상속주택·지방 저가주택 등의 특례가 누락된 경우

  • 소유지분이나 납세의무자 정보가 잘못 반영된 경우

  • 공시가격이 정정돼 종부세액이 달라진 경우

종부세는 국세청이 계산한 세액을 고지하는 방식이 기본이에요. 다만 종부세를 부과·고지받은 납세자도 법에서 정한 요건을 충족하면 경정청구를 할 수 있어요.

일반적인 경정청구는 종부세 납부기한이 지난 후 5년 이내에 진행해야 해요. 구체적인 법적 기준은 「국세기본법」 제45조의2 에서 확인할 수 있어요.

고지 내용에 이의가 있다면 고지서를 받은 날부터 90일 이내에 이의신청·심사청구·심판청구 등의 불복절차도 검토할 수 있어요.

경정청구와 불복절차는 신청기한과 진행 방식이 달라요. 특히 불복절차는 기한이 짧으므로 고지서의 처분 내용과 통지받은 날짜를 먼저 확인해야 해요.

경정청구를 신청했다고 환급이 확정되는 것은 아니에요. 최종 환급 여부와 금액은 당시 적용 법령과 신청기한, 증빙자료 및 과세관청의 검토 결과에 따라 결정돼요.

자주 묻는 질문

Q1. 집값이 12억 원을 넘으면 무조건 종합부동산세를 내나요?

아니에요. 실제 거래가격이나 시세가 아니라 공시가격을 기준으로 판단해요. 소유자의 지분과 다른 주택 보유 여부, 1세대 1주택 요건도 함께 확인해야 해요.

Q2. 부부 공동명의라면 각각 9억 원씩 공제되나요?

원칙적으로 각 배우자가 자기 지분에 해당하는 공시가격에서 각각 9억 원을 공제해요. 다만 공동명의 1주택자 특례를 신청하면 한 명을 납세의무자로 정해 12억 원의 기본공제와 연령·보유기간 세액공제를 적용받을 수 있어요.

Q3. 재산세를 냈는데 종합부동산세도 내야 하나요?

재산세와 종합부동산세는 서로 다른 세금이므로 모두 부과될 수 있어요. 다만 종부세를 계산할 때 일정한 재산세액을 공제해요.

Q4. 6월 1일 전에 주택을 팔면 종합부동산세를 내지 않나요?

종합부동산세는 6월 1일 현재 소유자를 기준으로 판단해요. 다만 소유권이 이전된 시점은 계약일만으로 판단하지 않아요. 잔금 지급일과 등기접수일 등을 함께 확인해야 해요.

Q5. 이미 낸 종합부동산세도 환급받을 수 있나요?

합산배제나 과세특례 등이 잘못 반영돼 세금을 많이 냈다면 경정청구를 검토할 수 있어요. 실제 환급 여부는 신청기한과 적용 요건, 증빙자료 및 과세관청의 검토 결과에 따라 달라져요.

종합부동산세, 공제와 특례가 제대로 반영됐는지 확인하세요

종부세는 주택의 가격만으로 결정되지 않아요. 과세기준일 현재의 소유 현황과 지분, 공시가격, 1세대 1주택 여부, 합산배제 및 과세특례를 함께 확인해야 해요.

특히 부부 공동명의 주택이나 상속주택·지방 저가주택을 보유했다면 어떤 특례를 적용하느냐에 따라 세액이 크게 달라질 수 있어요.

이미 종부세를 납부했더라도 공제나 특례가 잘못 반영돼 세금을 실제보다 많이 부담했다면 경정청구를 검토할 수 있어요.  과거 고지·납부 내역에서 잘못 반영된 항목이 있는지 직접 판단하기 어렵다면 세이브택스(SAVETAX) 환급을 통해 살펴볼 수 있어요.

세이브택스 환급은 선영회계법인이 직접 운영하며, 종부세처럼 주택 수와 소유지분, 공제·특례 적용이 중요한 세목도 관련 자료를 바탕으로 검토해요. 선영회계법인 소속 회계사가 과거 고지·납부 내역과 보유 관련 자료를 확인해 합산배제나 과세특례 등이 제대로 반영됐는지 살펴봐요.

복잡한 세무 지식이 없어도 온라인에서 약 1분 만에 환급 가능성을 무료로 조회할 수 있다는 점도 장점이에요. 조회 단계에서는 비용이 발생하지 않아 종부세를 더 낸 것은 아닌지 부담 없이 확인할 수 있고, 추가 검토 필요성이 확인되면 전문가의 검토를 거쳐 경정청구 진행 여부를 판단할 수 있어요.

경정청구 과정에서 세무서가 추가 자료를 요청하면 필요한 자료와 대응 방향도 안내받을 수 있어요. 다만 검토 결과 경정청구 대상에 해당하지 않거나 예상 환급액과 실제 환급액이 달라질 수도 있어요.

세이브택스 환급은 선영회계법인이 직접 운영해요. 선영회계법인 소속 회계사가 과거 종부세 고지·납부 내역과 보유 관련 자료를 바탕으로 합산배제나 과세특례, 1세대 1주택 공제 등이 제대로 반영됐는지 검토해요.

종부세처럼 주택 수와 소유지분, 공제·특례 적용이 서로 얽혀 있는 세목은 과세연도별 자료를 하나씩 맞춰보는 과정이 중요해요. 세무서가 경정청구 과정에서 추가 자료를 요청하면 필요한 자료와 대응 방향도 안내받을 수 있어요.

과거 고지 내용에서 빠진 공제나 특례가 있는지 궁금하다면 세이브택스 환급에서 관련 내역을 확인해 보세요.

※ 실제 과세 여부와 세액 및 환급 가능성은 해당 연도의 공시가격, 주택·토지 보유 현황, 적용 법령, 신청·청구기한, 증빙자료 및 과세관청의 검토 결과에 따라 달라질 수 있어요.

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